专利

发明专利

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2018-06-27

CN201810675888.7

2018-12-04

CN108932402A

430079 湖北省武汉市洪山区珞瑜路152号华中师范大学

湖北

本校为第一完成单位

1.一种蛋白质复合物识别方法，其特征在于：包括以下步骤：S1：将蛋白质相互作用网络看成是全连通图，预处理，得到多源动态蛋白质网络；S2：对多源动态蛋白质网络中的所有蛋白质节点进行聚类，得到初始的蛋白质聚类模块；S3：基于初始的蛋白质聚类模块的聚类偏好度与所述多源动态蛋白质网络的平均聚类偏好度的大小对初始的蛋白质聚类模块进行优化，得到更新的蛋白质复合物模块；S4：对更新的蛋白质复合物模块进行后期处理过程，去除在每个蛋白质复合物模块中与其他蛋白质节点没有相连边的孤立节点，并去除所有规模小于3的蛋白质复合物模块，经过处理得到的蛋白质复合物模块即为该方法识别的最优蛋白质复合物。

本发明公开了一种蛋白质复合物识别方法，其将蛋白质基因表达数据、GO功能注释数据及其相互作用数据进行整合，构建了多源动态蛋白质网络，然后基于局部密度与相对距离对蛋白质节点进行聚类，并对初始的蛋白质复合物聚类模块基于聚类偏好度与所述多源动态蛋白质网络的平均聚类偏好度的大小进行优化与更新，并最终实现蛋白质复合物的识别，从而控制了算法的局部搜索能力与全局搜索能力，挖掘出更具有生物学意义的动态复合物。