为探讨环境约束条件下的农业补贴效率及影响因素,本文以2004-2013年18个省份的经济社会发展数据为研究样本,在DEA方向性距离函数及其分解方法的分析框架内,评估农业补贴效率及分析效率损失的因素.结果表明:虽然农业补贴总量逐年攀升,但补贴效率并未有效改善,效率损失严重导致农业潜在产出提升空间非常明显;技术效率拉低了农业全要素生产率,同时影响了补贴的效果;虽然要素投入对于补贴有一定的挤出效应,面源污染也充抵了补贴带来的正效应,但产出的增长在一定程度上弥补了挤出效应和面源污染带来的损失.因此,提升技术水平、创新补贴方式、加大对生态农业的扶持力度等应是我国补贴发展的主要方向.